Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms