Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms