Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Q1O19441 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms