Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Speer3W4VSP1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms