Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms