Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgdr2Q9Z2J6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms