Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ap3b1Q9Z1T1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms