Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr4Q9Z1L2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr4Q9Z1L2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms