Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arih1Q9Z1K5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arih1Q9Z1K5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arih1Q9Z1K5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms