Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn3Q9WUK7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms