Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd6ipQ9WU78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd6ipQ9WU78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms