Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TapbpQ9R233 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TapbpQ9R233 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms