Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Psmb2Q9R1P3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb2Q9R1P3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms