Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntn3Q9R1A3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms