Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf4Q9R0L1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf4Q9R0L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms