Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek3Q9R0A5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms