Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkab1Q9R078 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkab1Q9R078 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms