Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copg1Q9QZE5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms