Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnnt3Q9QZ47 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnt3Q9QZ47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms