Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Exo1Q9QZ11 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo1Q9QZ11 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms