Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn4Q9QXZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms