Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyth1Q9QX11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyth1Q9QX11 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyth1Q9QX11 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms