Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt17Q9QWL7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt17Q9QWL7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms