Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul3Q9JLV5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms