Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms