Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upk3aQ9JKX8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms