Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufaf3Q9JKL4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms