Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ybx3Q9JKB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms