Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uchl3Q9JKB1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uchl3Q9JKB1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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