Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PigbQ9JJQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PigbQ9JJQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms