Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgpep1Q9ESW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pgpep1Q9ESW8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms