Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SelenofQ9ERR7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SelenofQ9ERR7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms