Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms