Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst4Q9EQW8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Ndst4Q9EQW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst4Q9EQW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Ndst4Q9EQW8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Ndst4Q9EQW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndst4Q9EQW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms