Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlr9Q9EQU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlr9Q9EQU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr9Q9EQU3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms