Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms