Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabarapQ9DCD6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabarapQ9DCD6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GabarapQ9DCD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms