Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MNCb-2875Q9DCB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms