Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok3Q9DBU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms