Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
March8Q9DBD2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March8Q9DBD2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms