Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms