Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdzd9Q9D9M4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzd9Q9D9M4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzd9Q9D9M4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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