Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms