Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lin37Q9D8N6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms