Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Borcs8Q9D6Y4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs8Q9D6Y4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs8Q9D6Y4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs8Q9D6Y4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs8Q9D6Y4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms