Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra4Q9D6F4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms