Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn11Q9D572 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms