Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc7Q9D541 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7Q9D541 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms