Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms