Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zbed3Q9D0L1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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